No Japão, em 2035, um acidente chamado "Burst" ocorreu em um projeto de pesquisa científica de ponta.O acidente deu à luz uma forma de vida artificial fora de controle-"Matter", que se espalhou rapidamente para todos os cantos do Canyon Heibi.A cidade de pesquisa, uma vez conhecida como a esperança da humanidade, agora foi bloqueada pelo governo e se tornou uma área proibida, onde ninguém ousa pisar. Dois anos depois, Aiko Tachiha, de 15 anos, perdeu sua família nesse desastre e viveu sozinho.Apenas quando ela pensou que tudo era uma conclusão precipitada, um estudante de transferência chamado Yuya Kamisaki trouxe uma verdade chocante: havia um segredo desconhecido escondido em seu corpo, e a chave para resolver esse mistério foi a origem do "incidente de explosão" - "ponto primário". O destino conecta os dois de perto, e com o desconhecido e o medo, o filho amado decide embarcar em uma jornada de incerteza na vida e na morte.Acompanhado por um grupo de perseguidores experientes, Yuya lidera o caminho, e eles atravessam o bloqueio e se infiltram na cidade esquecida.Quando o destino do garoto e da menina se encontram e assumem a importante tarefa de salvar a humanidade, uma verdade empoeirada está prestes a surgir ...