"লেগো নিনজা: দ্য মাস্টার অফ টর্নেডো" (২০১১) এর ইভেন্টগুলির পরে, নিনজাস - কে, জে, কোল, জ্যান, লয়েড এবং নয়া আরও মারাত্মক চ্যালেঞ্জের মুখোমুখি হয়েছিল।নিনজাগো, যে জমিটি একসময় শান্তি বজায় রেখেছিল, তা আবারও ছায়ায় ছড়িয়ে পড়েছিল এবং একটি নতুন শক্তিশালী শত্রু চুপচাপ শক্তভাবে জয়ী প্রশান্তি ভাঙার প্রয়াসে উঠেছিল।অভূতপূর্ব সঙ্কটের মুখোমুখি হয়ে নিনজাসকে অবশ্যই হাত মিলিয়ে অবশ্যই যোগ দিতে হবে এবং বিশ্বাস ও সাহসের দ্বারা পরিচালিত, ভাগ্যের বিচারের মুখোমুখি হতে হবে এবং তাদের প্রিয় বাড়িটি রক্ষা করতে হবে।