Natsume Takashi dapat melihat tubuh spiritual yang tidak dapat dideteksi oleh orang biasa sejak kecil, dan kemampuan khusus ini telah disembunyikan dengan cermat olehnya.Namun, karena ia mewarisi buku misterius yang ditinggalkan oleh almarhum neneknya Reiko, ia secara bertahap mengerti mengapa ia selalu dikelilingi oleh makhluk -makhluk gaib ini.