La historia se desarrolla en "Semilla de traje móvil Gundam", dos años después de que Zaft y Earth firmaron conjuntamente un tratado de paz, a saber, C.E.73. Al igual que la representante de OB, Kagarie Yula Asha, mantuvo conversaciones con el presidente de Zaft, Gilbert Durandal, miembros de las fuerzas especiales conjuntas de la Tierra "Phantom Dolor" allanó la base de Zaft Armory y robó tres de las últimas demandas móviles móviles. Esta búsqueda, originalmente llevada a cabo por refugiados que fueron exiliados a Aubu: Asan Sarah, y la tripulación de la "Minerva" de LHM -BB01, finalmente se transformó en una gran tormenta que sacude el orden mundial, empujando a todas las fuerzas al borde de la guerra nuevamente. La guerra reavivó, los engranajes del destino volvieron de nuevo, y un conflicto sobre la fe, el odio y la redención comenzó en silencio.