Kisah ini diatur dalam "Mobile Suit Gundam Seed", dua tahun setelah Zaft dan Earth bersama -sama menandatangani Perjanjian Damai, yaitu C.E.73. Sama seperti perwakilan OB Kagarie Yula Asha mengadakan pembicaraan dengan pembicara Zaft baru Gilbert Durandal, anggota Bumi yang lebih rendah dari Bumi dan Pain Pain Pain Pain. Pengejaran ini, yang awalnya dilakukan oleh para pengungsi yang diasingkan ke Aubu - Asan Sarah, dan kru LHM -BB01 "Minerva", akhirnya diubah menjadi badai besar yang mengguncang tatanan dunia, mendorong semua kekuatan ke ambang perang lagi. Perang itu menghidupkan kembali, persneling takdir berbalik lagi, dan konflik tentang iman, kebencian dan penebusan dengan tenang dimulai.